Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms