Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USB1Q9BQ65 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms