Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms