Protein–RNA interactions for Protein: Q99325

ATG40, Autophagy-related protein 40, yeastyeast

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG40Q99325 NPC2YDL046W 522 nt0.6□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 YDL196WYDL196W 330 nt0.6□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 YGR042WYGR042W 816 nt0.6□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 NFU1YKL040C 771 nt0.6□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 CMC4YMR194C-B 222 nt0.6□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.6□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 YAR009CYAR009C 3591 nt0.6□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 RIM20YOR275C 1986 nt0.59□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 YDR521WYDR521W 336 nt0.59□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 EAF6YJR082C 342 nt0.59□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 MMS4YBR098W 2076 nt0.59□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 YDL073WYDL073W 2955 nt0.58□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 SWF1YDR126W 1011 nt0.58□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 YER084W-AYER084W-A 513 nt0.58□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 EMC4YGL231C 573 nt0.58□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 PBI2YNL015W 228 nt0.58□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 CDC33YOL139C 642 nt0.58□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 GEA2YEL022W 4380 nt0.58□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 COG4YPR105C 2586 nt0.58□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 SLI15YBR156C 2097 nt0.58□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 YPR153WYPR153W 423 nt0.57□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 YJR003CYJR003C 1560 nt0.57□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 WAR1YML076C 2835 nt0.56□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 ZIP2YGL249W 2115 nt0.56□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.56□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 STE18YJR086W 333 nt0.56□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 RPS27AYKL156W 249 nt0.56□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 YNR025CYNR025C 360 nt0.56□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 YPL182CYPL182C 384 nt0.56□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 EFR3YMR212C 2349 nt0.56□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 WIP1YDR374W-A 270 nt0.55□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.55□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.55□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 IES4YOR189W 351 nt0.55□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.54□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.54□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.54□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.54□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.54□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.54□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.54□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.54□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.54□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.54□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.54□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 AIM29YKR074W 468 nt0.54□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 YML108WYML108W 318 nt0.54□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 RPB10YOR210W 213 nt0.54□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 TIM13YGR181W 318 nt0.53□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 YJL135WYJL135W 318 nt0.53□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 YOR029WYOR029W 336 nt0.53□□□□□ -2.32
ATG40Q99325 ALG13YGL047W 609 nt0.52□□□□□ -2.33
ATG40Q99325 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.52□□□□□ -2.33
ATG40Q99325 DBP6YNR038W 1890 nt0.52□□□□□ -2.33
ATG40Q99325 CLU1YMR012W 3834 nt0.52□□□□□ -2.33
ATG40Q99325 snR72snR72 98 nt0.51□□□□□ -2.33
ATG40Q99325 BFR2YDR299W 1605 nt0.51□□□□□ -2.33
ATG40Q99325 GPG1YGL121C 381 nt0.51□□□□□ -2.33
ATG40Q99325 YBL071CYBL071C 309 nt0.51□□□□□ -2.33
ATG40Q99325 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.51□□□□□ -2.33
ATG40Q99325 ZEO1YOL109W 342 nt0.5□□□□□ -2.33
ATG40Q99325 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.5□□□□□ -2.33
ATG40Q99325 UTP10YJL109C 5310 nt0.5□□□□□ -2.33
ATG40Q99325 PAC1YOR269W 1485 nt0.49□□□□□ -2.33
ATG40Q99325 LTE1YAL024C 4308 nt0.49□□□□□ -2.33
ATG40Q99325 PKH2YOL100W 3246 nt0.49□□□□□ -2.33
ATG40Q99325 STF2YGR008C 255 nt0.49□□□□□ -2.33
ATG40Q99325 YHR125WYHR125W 306 nt0.49□□□□□ -2.33
ATG40Q99325 YKL202WYKL202W 582 nt0.49□□□□□ -2.33
ATG40Q99325 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.49□□□□□ -2.33
ATG40Q99325 YOL160WYOL160W 342 nt0.49□□□□□ -2.33
ATG40Q99325 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.49□□□□□ -2.33
ATG40Q99325 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.49□□□□□ -2.33
ATG40Q99325 LOA1YPR139C 903 nt0.49□□□□□ -2.33
ATG40Q99325 YDL011CYDL011C 324 nt0.48□□□□□ -2.33
ATG40Q99325 YDR344CYDR344C 444 nt0.48□□□□□ -2.33
ATG40Q99325 ISD11YER048W-A 285 nt0.48□□□□□ -2.33
ATG40Q99325 INA22YIR024C 651 nt0.48□□□□□ -2.33
ATG40Q99325 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.48□□□□□ -2.33
ATG40Q99325 snR51snR51 107 nt0.48□□□□□ -2.33
ATG40Q99325 YGR290WYGR290W 444 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG40Q99325 YLR287CYLR287C 1068 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG40Q99325 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG40Q99325 YMR160WYMR160W 2451 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG40Q99325 OST1YJL002C 1431 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG40Q99325 YML002WYML002W 2214 nt0.46□□□□□ -2.34
ATG40Q99325 PAN2YGL094C 3348 nt0.46□□□□□ -2.34
ATG40Q99325 YHL041WYHL041W 450 nt0.46□□□□□ -2.34
ATG40Q99325 ECM12YHR021W-A 456 nt0.46□□□□□ -2.34
ATG40Q99325 YHR130CYHR130C 336 nt0.46□□□□□ -2.34
ATG40Q99325 PRP16YKR086W 3216 nt0.45□□□□□ -2.34
ATG40Q99325 BI2Q0110 1272 nt0.45□□□□□ -2.34
ATG40Q99325 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.45□□□□□ -2.34
ATG40Q99325 FYV7YLR068W 456 nt0.45□□□□□ -2.34
ATG40Q99325 HUG1YML058W-A 207 nt0.45□□□□□ -2.34
ATG40Q99325 RAD34YDR314C 2079 nt0.45□□□□□ -2.34
ATG40Q99325 SDH7YDR511W 402 nt0.44□□□□□ -2.34
ATG40Q99325 YHL042WYHL042W 453 nt0.44□□□□□ -2.34
ATG40Q99325 YNL122CYNL122C 348 nt0.43□□□□□ -2.34
ATG40Q99325 RPS30BYOR182C 192 nt0.43□□□□□ -2.34
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