Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TAF4BQ92750 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF4BQ92750 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms