Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3C3Q8NEB9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms