Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KSR1Q8IVT5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KSR1Q8IVT5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KSR1Q8IVT5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KSR1Q8IVT5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KSR1Q8IVT5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KSR1Q8IVT5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KSR1Q8IVT5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KSR1Q8IVT5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KSR1Q8IVT5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KSR1Q8IVT5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KSR1Q8IVT5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KSR1Q8IVT5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KSR1Q8IVT5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KSR1Q8IVT5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KSR1Q8IVT5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KSR1Q8IVT5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KSR1Q8IVT5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KSR1Q8IVT5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KSR1Q8IVT5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KSR1Q8IVT5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KSR1Q8IVT5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KSR1Q8IVT5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KSR1Q8IVT5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KSR1Q8IVT5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KSR1Q8IVT5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KSR1Q8IVT5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KSR1Q8IVT5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KSR1Q8IVT5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KSR1Q8IVT5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms