Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms