Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms