Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms