Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms