Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms