Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms