Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms