Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms