Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTU2Q2VPK5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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