Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SYPL1Q16563 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SYPL1Q16563 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYPL1Q16563 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYPL1Q16563 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYPL1Q16563 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYPL1Q16563 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYPL1Q16563 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYPL1Q16563 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYPL1Q16563 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYPL1Q16563 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYPL1Q16563 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYPL1Q16563 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYPL1Q16563 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYPL1Q16563 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYPL1Q16563 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYPL1Q16563 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYPL1Q16563 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYPL1Q16563 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYPL1Q16563 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYPL1Q16563 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYPL1Q16563 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYPL1Q16563 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYPL1Q16563 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYPL1Q16563 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYPL1Q16563 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYPL1Q16563 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYPL1Q16563 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYPL1Q16563 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYPL1Q16563 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SYPL1Q16563 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYPL1Q16563 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYPL1Q16563 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYPL1Q16563 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYPL1Q16563 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYPL1Q16563 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYPL1Q16563 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYPL1Q16563 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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