Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPAQ15257 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPAQ15257 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPAQ15257 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPAQ15257 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPAQ15257 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPAQ15257 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPAQ15257 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPAQ15257 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPAQ15257 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPAQ15257 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPAQ15257 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPAQ15257 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPAQ15257 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPAQ15257 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPAQ15257 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPAQ15257 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPAQ15257 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPAQ15257 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPAQ15257 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPAQ15257 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPAQ15257 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPAQ15257 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPAQ15257 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPAQ15257 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
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PTPAQ15257 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
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PTPAQ15257 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
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PTPAQ15257 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPAQ15257 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPAQ15257 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPAQ15257 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPAQ15257 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPAQ15257 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPAQ15257 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPAQ15257 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPAQ15257 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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PTPAQ15257 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
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PTPAQ15257 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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PTPAQ15257 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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PTPAQ15257 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
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PTPAQ15257 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
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PTPAQ15257 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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PTPAQ15257 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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PTPAQ15257 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPAQ15257 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPAQ15257 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPAQ15257 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPAQ15257 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPAQ15257 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPAQ15257 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPAQ15257 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPAQ15257 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPAQ15257 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPAQ15257 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPAQ15257 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPAQ15257 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPAQ15257 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPAQ15257 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPAQ15257 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPAQ15257 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPAQ15257 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPAQ15257 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPAQ15257 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPAQ15257 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPAQ15257 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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