Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms