Protein–RNA interactions for Protein: Q12488

PSF1, DNA replication complex GINS protein PSF1, yeastyeast

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PSF1Q12488 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.71□□□□□ -2.3
PSF1Q12488 RPS30BYOR182C 192 nt0.71□□□□□ -2.3
PSF1Q12488 EFR3YMR212C 2349 nt0.71□□□□□ -2.3
PSF1Q12488 MMS4YBR098W 2076 nt0.71□□□□□ -2.3
PSF1Q12488 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.7□□□□□ -2.3
PSF1Q12488 RRT1YBL048W 312 nt0.7□□□□□ -2.3
PSF1Q12488 PDE2YOR360C 1581 nt0.7□□□□□ -2.3
PSF1Q12488 SEC1YDR164C 2175 nt0.69□□□□□ -2.3
PSF1Q12488 NPC2YDL046W 522 nt0.69□□□□□ -2.3
PSF1Q12488 STE18YJR086W 333 nt0.69□□□□□ -2.3
PSF1Q12488 SLI15YBR156C 2097 nt0.69□□□□□ -2.3
PSF1Q12488 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.68□□□□□ -2.3
PSF1Q12488 YML108WYML108W 318 nt0.68□□□□□ -2.3
PSF1Q12488 CDC33YOL139C 642 nt0.68□□□□□ -2.3
PSF1Q12488 YPL182CYPL182C 384 nt0.68□□□□□ -2.3
PSF1Q12488 ZIP2YGL249W 2115 nt0.67□□□□□ -2.3
PSF1Q12488 NHP2YDL208W 471 nt0.67□□□□□ -2.3
PSF1Q12488 YER084W-AYER084W-A 513 nt0.67□□□□□ -2.3
PSF1Q12488 NFU1YKL040C 771 nt0.67□□□□□ -2.3
PSF1Q12488 CMC4YMR194C-B 222 nt0.67□□□□□ -2.3
PSF1Q12488 YOR199WYOR199W 330 nt0.67□□□□□ -2.3
PSF1Q12488 YCS4YLR272C 3531 nt0.67□□□□□ -2.3
PSF1Q12488 COG4YPR105C 2586 nt0.67□□□□□ -2.3
PSF1Q12488 NUP157YER105C 4176 nt0.67□□□□□ -2.3
PSF1Q12488 GEA2YEL022W 4380 nt0.66□□□□□ -2.3
PSF1Q12488 TIM13YGR181W 318 nt0.66□□□□□ -2.3
PSF1Q12488 INA22YIR024C 651 nt0.66□□□□□ -2.3
PSF1Q12488 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.66□□□□□ -2.3
PSF1Q12488 RPB10YOR210W 213 nt0.66□□□□□ -2.3
PSF1Q12488 WAR1YML076C 2835 nt0.66□□□□□ -2.3
PSF1Q12488 YJR003CYJR003C 1560 nt0.66□□□□□ -2.3
PSF1Q12488 OST1YJL002C 1431 nt0.65□□□□□ -2.3
PSF1Q12488 YDR521WYDR521W 336 nt0.65□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 YHR125WYHR125W 306 nt0.65□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 AIM29YKR074W 468 nt0.65□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.65□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 YDL196WYDL196W 330 nt0.64□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt0.64□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.64□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 ALY2YJL084C 3141 nt0.64□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.63□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.63□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.63□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.63□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.63□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.63□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.63□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.63□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.63□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.63□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.63□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 IES4YOR189W 351 nt0.63□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 UBP3YER151C 2739 nt0.62□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 WIP1YDR374W-A 270 nt0.62□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 YGR042WYGR042W 816 nt0.62□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.62□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 YBL071CYBL071C 309 nt0.62□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 YPR153WYPR153W 423 nt0.62□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 RKR1YMR247C 4689 nt0.62□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 SWF1YDR126W 1011 nt0.61□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 YHR130CYHR130C 336 nt0.61□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 YKL202WYKL202W 582 nt0.61□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.61□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.61□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 YDL158CYDL158C 309 nt0.6□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 GPG1YGL121C 381 nt0.6□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 YGR290WYGR290W 444 nt0.6□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 YJL135WYJL135W 318 nt0.6□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 YLR287CYLR287C 1068 nt0.6□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 ZEO1YOL109W 342 nt0.6□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 PKH2YOL100W 3246 nt0.59□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 DBP6YNR038W 1890 nt0.59□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 snR72snR72 98 nt0.59□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 ALG13YGL047W 609 nt0.59□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 YNL122CYNL122C 348 nt0.59□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.59□□□□□ -2.31
PSF1Q12488 YMR160WYMR160W 2451 nt0.58□□□□□ -2.32
PSF1Q12488 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.58□□□□□ -2.32
PSF1Q12488 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.58□□□□□ -2.32
PSF1Q12488 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.58□□□□□ -2.32
PSF1Q12488 YDL011CYDL011C 324 nt0.57□□□□□ -2.32
PSF1Q12488 BI2Q0110 1272 nt0.57□□□□□ -2.32
PSF1Q12488 snR51snR51 107 nt0.57□□□□□ -2.32
PSF1Q12488 snR54snR54 86 nt0.57□□□□□ -2.32
PSF1Q12488 FYV7YLR068W 456 nt0.56□□□□□ -2.32
PSF1Q12488 DIE2YGR227W 1578 nt0.55□□□□□ -2.32
PSF1Q12488 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.55□□□□□ -2.32
PSF1Q12488 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.55□□□□□ -2.32
PSF1Q12488 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.55□□□□□ -2.32
PSF1Q12488 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.55□□□□□ -2.32
PSF1Q12488 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.55□□□□□ -2.32
PSF1Q12488 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.55□□□□□ -2.32
PSF1Q12488 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.55□□□□□ -2.32
PSF1Q12488 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.55□□□□□ -2.32
PSF1Q12488 ECL1YGR146C 636 nt0.55□□□□□ -2.32
PSF1Q12488 YOL160WYOL160W 342 nt0.55□□□□□ -2.32
PSF1Q12488 LOA1YPR139C 903 nt0.55□□□□□ -2.32
PSF1Q12488 ISD11YER048W-A 285 nt0.54□□□□□ -2.32
PSF1Q12488 BFR2YDR299W 1605 nt0.53□□□□□ -2.32
PSF1Q12488 SDH7YDR511W 402 nt0.53□□□□□ -2.32
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