Protein–RNA interactions for Protein: Q12402

YOP1, Protein YOP1, yeastyeast

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YOP1Q12402 YLL054CYLL054C 2532 nt1.24□□□□□ -2.21
YOP1Q12402 RPS20YHL015W 366 nt1.24□□□□□ -2.21
YOP1Q12402 YJL135WYJL135W 318 nt1.24□□□□□ -2.21
YOP1Q12402 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.24□□□□□ -2.21
YOP1Q12402 YOL160WYOL160W 342 nt1.24□□□□□ -2.21
YOP1Q12402 snR14snR14 160 nt1.24□□□□□ -2.21
YOP1Q12402 YPL261CYPL261C 309 nt1.24□□□□□ -2.21
YOP1Q12402 SCW11YGL028C 1629 nt1.24□□□□□ -2.21
YOP1Q12402 PIK1YNL267W 3201 nt1.24□□□□□ -2.21
YOP1Q12402 AZF1YOR113W 2745 nt1.23□□□□□ -2.21
YOP1Q12402 HMRA1YCR097W 381 nt1.23□□□□□ -2.21
YOP1Q12402 NPC2YDL046W 522 nt1.23□□□□□ -2.21
YOP1Q12402 CDC36YDL165W 576 nt1.23□□□□□ -2.21
YOP1Q12402 YOR029WYOR029W 336 nt1.23□□□□□ -2.21
YOP1Q12402 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.23□□□□□ -2.21
YOP1Q12402 YSY6YBR162W-A 198 nt1.23□□□□□ -2.21
YOP1Q12402 YDL211CYDL211C 1119 nt1.22□□□□□ -2.21
YOP1Q12402 CSN9YDR179C 489 nt1.22□□□□□ -2.21
YOP1Q12402 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt1.22□□□□□ -2.21
YOP1Q12402 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt1.22□□□□□ -2.21
YOP1Q12402 YBR012CYBR012C 420 nt1.22□□□□□ -2.21
YOP1Q12402 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.22□□□□□ -2.21
YOP1Q12402 MDS3YGL197W 4464 nt1.22□□□□□ -2.21
YOP1Q12402 MAD1YGL086W 2250 nt1.22□□□□□ -2.21
YOP1Q12402 RIM20YOR275C 1986 nt1.21□□□□□ -2.22
YOP1Q12402 NUP188YML103C 4968 nt1.21□□□□□ -2.22
YOP1Q12402 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.21□□□□□ -2.22
YOP1Q12402 YCS4YLR272C 3531 nt1.21□□□□□ -2.22
YOP1Q12402 BIL1YOR304C-A 231 nt1.2□□□□□ -2.22
YOP1Q12402 SLI15YBR156C 2097 nt1.19□□□□□ -2.22
YOP1Q12402 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt1.19□□□□□ -2.22
YOP1Q12402 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.19□□□□□ -2.22
YOP1Q12402 AHC1YOR023C 1701 nt1.19□□□□□ -2.22
YOP1Q12402 MPT5YGL178W 2580 nt1.19□□□□□ -2.22
YOP1Q12402 SPT21YMR179W 2277 nt1.19□□□□□ -2.22
YOP1Q12402 MSN5YDR335W 3675 nt1.19□□□□□ -2.22
YOP1Q12402 SWI4YER111C 3282 nt1.18□□□□□ -2.22
YOP1Q12402 LCD1YDR499W 2244 nt1.18□□□□□ -2.22
YOP1Q12402 YDR426CYDR426C 378 nt1.18□□□□□ -2.22
YOP1Q12402 PCC1YKR095W-A 267 nt1.18□□□□□ -2.22
YOP1Q12402 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt1.18□□□□□ -2.22
YOP1Q12402 RAD34YDR314C 2079 nt1.18□□□□□ -2.22
YOP1Q12402 PIP2YOR363C 2991 nt1.18□□□□□ -2.22
YOP1Q12402 snR56snR56 88 nt1.17□□□□□ -2.22
YOP1Q12402 YLR255CYLR255C 354 nt1.17□□□□□ -2.22
YOP1Q12402 RSM22YKL155C 1887 nt1.17□□□□□ -2.22
YOP1Q12402 COG4YPR105C 2586 nt1.17□□□□□ -2.22
YOP1Q12402 SPC98YNL126W 2541 nt1.17□□□□□ -2.22
YOP1Q12402 NIP100YPL174C 2607 nt1.17□□□□□ -2.22
YOP1Q12402 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt1.16□□□□□ -2.22
YOP1Q12402 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt1.16□□□□□ -2.22
YOP1Q12402 YIL102CYIL102C 306 nt1.16□□□□□ -2.22
YOP1Q12402 YLL020CYLL020C 306 nt1.16□□□□□ -2.22
YOP1Q12402 ALY2YJL084C 3141 nt1.16□□□□□ -2.22
YOP1Q12402 BRR2YER172C 6492 nt1.16□□□□□ -2.22
YOP1Q12402 APL3YBL037W 3078 nt1.15□□□□□ -2.22
YOP1Q12402 RPL35AYDL191W 363 nt1.15□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 GIM4YEL003W 336 nt1.15□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.15□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 RRT15YLR162W-A 189 nt1.15□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 YPR063CYPR063C 423 nt1.15□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 YPR197CYPR197C 564 nt1.15□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 AIM44YPL158C 2277 nt1.15□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 RAD9YDR217C 3930 nt1.14□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt1.14□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt1.14□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt1.14□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt1.14□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt1.14□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 MAM33YIL070C 801 nt1.14□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 COA6YMR244C-A 315 nt1.13□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 SLD3YGL113W 2007 nt1.13□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 CDC39YCR093W 6327 nt1.13□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 MMS4YBR098W 2076 nt1.12□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 CAT8YMR280C 4302 nt1.12□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 FIG4YNL325C 2640 nt1.12□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 SET3YKR029C 2256 nt1.12□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt1.12□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 YIR044CYIR044C 186 nt1.12□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 HTB2YBL002W 396 nt1.12□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.12□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.12□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 YJR011CYJR011C 786 nt1.11□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 IFH1YLR223C 3258 nt1.11□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 NUP145YGL092W 3954 nt1.1□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 PKH2YOL100W 3246 nt1.1□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt1.1□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 PFD1YJL179W 330 nt1.1□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 YAR029WYAR029W 225 nt1.1□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 EAF1YDR359C 2949 nt1.1□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 CUL3YGR003W 2235 nt1.09□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 STO1YMR125W 2586 nt1.09□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 YDL206WYDL206W 2289 nt1.09□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 NST1YNL091W 3723 nt1.09□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 STB6YKL072W 2301 nt1.09□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 GPG1YGL121C 381 nt1.09□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 TMA10YLR327C 261 nt1.09□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 YAF9YNL107W 681 nt1.09□□□□□ -2.23
YOP1Q12402 RPL34BYIL052C 366 nt1.08□□□□□ -2.24
YOP1Q12402 PDE2YOR360C 1581 nt1.08□□□□□ -2.24
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