Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms