Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNG1Q06432 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms