Protein–RNA interactions for Protein: Q04004

PLP1, Phosducin-like protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PLP1Q04004 SPO13YHR014W 876 nt0.26□□□□□ -2.37
PLP1Q04004 RPS24BYIL069C 408 nt0.26□□□□□ -2.37
PLP1Q04004 RCN2YOR220W 798 nt0.26□□□□□ -2.37
PLP1Q04004 YOR282WYOR282W 321 nt0.26□□□□□ -2.37
PLP1Q04004 IRC16YPR038W 360 nt0.26□□□□□ -2.37
PLP1Q04004 MPC1YGL080W 393 nt0.25□□□□□ -2.37
PLP1Q04004 RPL9AYGL147C 576 nt0.25□□□□□ -2.37
PLP1Q04004 YJR087WYJR087W 351 nt0.25□□□□□ -2.37
PLP1Q04004 ECM9YKR004C 1134 nt0.25□□□□□ -2.37
PLP1Q04004 YLR252WYLR252W 306 nt0.25□□□□□ -2.37
PLP1Q04004 YPR039WYPR039W 336 nt0.25□□□□□ -2.37
PLP1Q04004 YER135CYER135C 393 nt0.24□□□□□ -2.37
PLP1Q04004 YOR218CYOR218C 420 nt0.24□□□□□ -2.37
PLP1Q04004 AFR1YDR085C 1863 nt0.23□□□□□ -2.37
PLP1Q04004 YER175W-AYER175W-A 165 nt0.23□□□□□ -2.37
PLP1Q04004 RPL26BYGR034W 384 nt0.23□□□□□ -2.37
PLP1Q04004 UBC7YMR022W 498 nt0.23□□□□□ -2.37
PLP1Q04004 SBH1YER087C-B 249 nt0.22□□□□□ -2.37
PLP1Q04004 YAL066WYAL066W 309 nt0.22□□□□□ -2.37
PLP1Q04004 AFB1YLR040C 675 nt0.22□□□□□ -2.37
PLP1Q04004 YCK3YER123W 1575 nt0.22□□□□□ -2.37
PLP1Q04004 ESP1YGR098C 4893 nt0.22□□□□□ -2.37
PLP1Q04004 YDR269CYDR269C 324 nt0.21□□□□□ -2.38
PLP1Q04004 GPG1YGL121C 381 nt0.21□□□□□ -2.38
PLP1Q04004 ZIP2YGL249W 2115 nt0.21□□□□□ -2.38
PLP1Q04004 APQ13YJL075C 417 nt0.21□□□□□ -2.38
PLP1Q04004 UTP20YBL004W 7482 nt0.2□□□□□ -2.38
PLP1Q04004 YDR344CYDR344C 444 nt0.2□□□□□ -2.38
PLP1Q04004 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.2□□□□□ -2.38
PLP1Q04004 PHS1YJL097W 654 nt0.2□□□□□ -2.38
PLP1Q04004 ULP2YIL031W 3105 nt0.2□□□□□ -2.38
PLP1Q04004 HUR1YGL168W 333 nt0.19□□□□□ -2.38
PLP1Q04004 YGL239CYGL239C 315 nt0.19□□□□□ -2.38
PLP1Q04004 YJL135WYJL135W 318 nt0.19□□□□□ -2.38
PLP1Q04004 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.19□□□□□ -2.38
PLP1Q04004 RPS30BYOR182C 192 nt0.19□□□□□ -2.38
PLP1Q04004 BSC3YLR465C 309 nt0.17□□□□□ -2.38
PLP1Q04004 BEM3YPL115C 3387 nt0.17□□□□□ -2.38
PLP1Q04004 FYV10YIL097W 1551 nt0.16□□□□□ -2.38
PLP1Q04004 PAU12YGR294W 363 nt0.16□□□□□ -2.38
PLP1Q04004 UBX4YMR067C 1251 nt0.16□□□□□ -2.38
PLP1Q04004 MLP2YIL149C 5040 nt0.15□□□□□ -2.39
PLP1Q04004 SLX9YGR081C 633 nt0.15□□□□□ -2.39
PLP1Q04004 STF2YGR008C 255 nt0.14□□□□□ -2.39
PLP1Q04004 YBR064WYBR064W 429 nt0.14□□□□□ -2.39
PLP1Q04004 PKH2YOL100W 3246 nt0.13□□□□□ -2.39
PLP1Q04004 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.13□□□□□ -2.39
PLP1Q04004 YKL044WYKL044W 321 nt0.13□□□□□ -2.39
PLP1Q04004 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.13□□□□□ -2.39
PLP1Q04004 RPL26AYLR344W 384 nt0.13□□□□□ -2.39
PLP1Q04004 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.13□□□□□ -2.39
PLP1Q04004 YOL029CYOL029C 606 nt0.13□□□□□ -2.39
PLP1Q04004 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.13□□□□□ -2.39
PLP1Q04004 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.13□□□□□ -2.39
PLP1Q04004 TRS65YGR166W 1683 nt0.13□□□□□ -2.39
PLP1Q04004 ASE1YOR058C 2658 nt0.13□□□□□ -2.39
PLP1Q04004 AI1Q0050 2505 nt0.13□□□□□ -2.39
PLP1Q04004 BIG1YHR101C 1008 nt0.12□□□□□ -2.39
PLP1Q04004 YIL029CYIL029C 429 nt0.12□□□□□ -2.39
PLP1Q04004 ILM1YJR118C 612 nt0.12□□□□□ -2.39
PLP1Q04004 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.12□□□□□ -2.39
PLP1Q04004 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.12□□□□□ -2.39
PLP1Q04004 CDC33YOL139C 642 nt0.12□□□□□ -2.39
PLP1Q04004 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.12□□□□□ -2.39
PLP1Q04004 YPL044CYPL044C 549 nt0.11□□□□□ -2.39
PLP1Q04004 MLP1YKR095W 5628 nt0.11□□□□□ -2.39
PLP1Q04004 MCM10YIL150C 1716 nt0.1□□□□□ -2.39
PLP1Q04004 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.1□□□□□ -2.39
PLP1Q04004 YNL050CYNL050C 813 nt0.1□□□□□ -2.39
PLP1Q04004 IPP1YBR011C 864 nt0.1□□□□□ -2.39
PLP1Q04004 PET111YMR257C 2403 nt0.1□□□□□ -2.39
PLP1Q04004 YGR025WYGR025W 303 nt0.09□□□□□ -2.4
PLP1Q04004 VMA21YGR105W 234 nt0.09□□□□□ -2.4
PLP1Q04004 YLR198CYLR198C 360 nt0.09□□□□□ -2.4
PLP1Q04004 YOL160WYOL160W 342 nt0.09□□□□□ -2.4
PLP1Q04004 EFR3YMR212C 2349 nt0.09□□□□□ -2.4
PLP1Q04004 RAD34YDR314C 2079 nt0.09□□□□□ -2.4
PLP1Q04004 snR13snR13 124 nt0.08□□□□□ -2.4
PLP1Q04004 GRX5YPL059W 453 nt0.08□□□□□ -2.4
PLP1Q04004 YPL261CYPL261C 309 nt0.08□□□□□ -2.4
PLP1Q04004 VIK1YPL253C 1944 nt0.07□□□□□ -2.4
PLP1Q04004 snR72snR72 98 nt0.07□□□□□ -2.4
PLP1Q04004 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.07□□□□□ -2.4
PLP1Q04004 HUG1YML058W-A 207 nt0.07□□□□□ -2.4
PLP1Q04004 BIR1YJR089W 2865 nt0.07□□□□□ -2.4
PLP1Q04004 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.06□□□□□ -2.4
PLP1Q04004 SEM1YDR363W-A 270 nt0.06□□□□□ -2.4
PLP1Q04004 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.06□□□□□ -2.4
PLP1Q04004 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.06□□□□□ -2.4
PLP1Q04004 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.06□□□□□ -2.4
PLP1Q04004 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.06□□□□□ -2.4
PLP1Q04004 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.06□□□□□ -2.4
PLP1Q04004 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.06□□□□□ -2.4
PLP1Q04004 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.06□□□□□ -2.4
PLP1Q04004 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.06□□□□□ -2.4
PLP1Q04004 YGR290WYGR290W 444 nt0.06□□□□□ -2.4
PLP1Q04004 PRP21YJL203W 843 nt0.06□□□□□ -2.4
PLP1Q04004 INP2YMR163C 2118 nt0.06□□□□□ -2.4
PLP1Q04004 IQG1YPL242C 4488 nt0.05□□□□□ -2.4
PLP1Q04004 YDR029WYDR029W 315 nt0.05□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18 ms