Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EXOSC10Q01780 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms