Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms