Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.4 ms