Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AFDNP55196 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AFDNP55196 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AFDNP55196 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AFDNP55196 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AFDNP55196 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AFDNP55196 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AFDNP55196 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AFDNP55196 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AFDNP55196 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AFDNP55196 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AFDNP55196 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AFDNP55196 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AFDNP55196 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AFDNP55196 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AFDNP55196 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AFDNP55196 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AFDNP55196 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AFDNP55196 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AFDNP55196 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AFDNP55196 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AFDNP55196 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AFDNP55196 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AFDNP55196 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AFDNP55196 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AFDNP55196 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AFDNP55196 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AFDNP55196 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AFDNP55196 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AFDNP55196 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AFDNP55196 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AFDNP55196 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AFDNP55196 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AFDNP55196 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AFDNP55196 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AFDNP55196 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
AFDNP55196 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
AFDNP55196 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AFDNP55196 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AFDNP55196 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AFDNP55196 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AFDNP55196 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AFDNP55196 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AFDNP55196 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
AFDNP55196 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AFDNP55196 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AFDNP55196 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AFDNP55196 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AFDNP55196 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AFDNP55196 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AFDNP55196 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AFDNP55196 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AFDNP55196 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AFDNP55196 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AFDNP55196 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AFDNP55196 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AFDNP55196 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AFDNP55196 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AFDNP55196 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AFDNP55196 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AFDNP55196 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AFDNP55196 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AFDNP55196 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AFDNP55196 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AFDNP55196 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AFDNP55196 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
AFDNP55196 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AFDNP55196 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AFDNP55196 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AFDNP55196 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AFDNP55196 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AFDNP55196 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AFDNP55196 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AFDNP55196 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AFDNP55196 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AFDNP55196 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AFDNP55196 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AFDNP55196 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AFDNP55196 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AFDNP55196 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AFDNP55196 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AFDNP55196 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AFDNP55196 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AFDNP55196 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AFDNP55196 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AFDNP55196 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AFDNP55196 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AFDNP55196 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AFDNP55196 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AFDNP55196 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
AFDNP55196 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AFDNP55196 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
AFDNP55196 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AFDNP55196 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
AFDNP55196 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AFDNP55196 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AFDNP55196 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AFDNP55196 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AFDNP55196 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AFDNP55196 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms