Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms