Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATRXP46100 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATRXP46100 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATRXP46100 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATRXP46100 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATRXP46100 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATRXP46100 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATRXP46100 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATRXP46100 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATRXP46100 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATRXP46100 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATRXP46100 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATRXP46100 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATRXP46100 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATRXP46100 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATRXP46100 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRXP46100 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRXP46100 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRXP46100 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRXP46100 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRXP46100 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRXP46100 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRXP46100 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRXP46100 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRXP46100 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRXP46100 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRXP46100 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRXP46100 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRXP46100 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRXP46100 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRXP46100 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRXP46100 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRXP46100 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRXP46100 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRXP46100 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRXP46100 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRXP46100 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRXP46100 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRXP46100 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRXP46100 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRXP46100 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRXP46100 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRXP46100 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRXP46100 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRXP46100 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRXP46100 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRXP46100 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRXP46100 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRXP46100 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRXP46100 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRXP46100 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRXP46100 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRXP46100 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRXP46100 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRXP46100 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRXP46100 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRXP46100 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRXP46100 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRXP46100 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRXP46100 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRXP46100 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRXP46100 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRXP46100 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRXP46100 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRXP46100 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRXP46100 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRXP46100 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRXP46100 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRXP46100 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRXP46100 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRXP46100 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRXP46100 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRXP46100 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRXP46100 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRXP46100 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRXP46100 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRXP46100 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRXP46100 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRXP46100 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRXP46100 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRXP46100 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRXP46100 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRXP46100 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRXP46100 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRXP46100 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRXP46100 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRXP46100 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRXP46100 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRXP46100 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRXP46100 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRXP46100 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRXP46100 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRXP46100 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRXP46100 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRXP46100 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRXP46100 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATRXP46100 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRXP46100 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRXP46100 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRXP46100 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms