Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGER2P43116 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms