Protein–RNA interactions for Protein: P36164

TVP38, Golgi apparatus membrane protein TVP38, yeastyeast

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TVP38P36164 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.72□□□□□ -2.29
TVP38P36164 YNR025CYNR025C 360 nt0.72□□□□□ -2.29
TVP38P36164 TSC3YBR058C-A 243 nt0.72□□□□□ -2.29
TVP38P36164 FIG4YNL325C 2640 nt0.72□□□□□ -2.29
TVP38P36164 SLD3YGL113W 2007 nt0.72□□□□□ -2.29
TVP38P36164 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.71□□□□□ -2.3
TVP38P36164 AIM9YER080W 1884 nt0.71□□□□□ -2.3
TVP38P36164 YER084W-AYER084W-A 513 nt0.71□□□□□ -2.3
TVP38P36164 EMC4YGL231C 573 nt0.71□□□□□ -2.3
TVP38P36164 NFU1YKL040C 771 nt0.71□□□□□ -2.3
TVP38P36164 YLR269CYLR269C 351 nt0.71□□□□□ -2.3
TVP38P36164 YBR071WYBR071W 636 nt0.71□□□□□ -2.3
TVP38P36164 ZIP1YDR285W 2628 nt0.71□□□□□ -2.3
TVP38P36164 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.7□□□□□ -2.3
TVP38P36164 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.7□□□□□ -2.3
TVP38P36164 CDC33YOL139C 642 nt0.69□□□□□ -2.3
TVP38P36164 YCR001WYCR001W 315 nt0.68□□□□□ -2.3
TVP38P36164 WIP1YDR374W-A 270 nt0.68□□□□□ -2.3
TVP38P36164 CYC7YEL039C 342 nt0.68□□□□□ -2.3
TVP38P36164 YGL239CYGL239C 315 nt0.68□□□□□ -2.3
TVP38P36164 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.68□□□□□ -2.3
TVP38P36164 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.68□□□□□ -2.3
TVP38P36164 SET3YKR029C 2256 nt0.68□□□□□ -2.3
TVP38P36164 GEA2YEL022W 4380 nt0.68□□□□□ -2.3
TVP38P36164 YLL032CYLL032C 2478 nt0.67□□□□□ -2.3
TVP38P36164 NOC3YLR002C 1992 nt0.67□□□□□ -2.3
TVP38P36164 YDR114CYDR114C 303 nt0.67□□□□□ -2.3
TVP38P36164 MXR1YER042W 555 nt0.67□□□□□ -2.3
TVP38P36164 BIG1YHR101C 1008 nt0.67□□□□□ -2.3
TVP38P36164 MRPL31YKL138C 396 nt0.67□□□□□ -2.3
TVP38P36164 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.67□□□□□ -2.3
TVP38P36164 YPR153WYPR153W 423 nt0.67□□□□□ -2.3
TVP38P36164 ULP2YIL031W 3105 nt0.67□□□□□ -2.3
TVP38P36164 MPT5YGL178W 2580 nt0.66□□□□□ -2.3
TVP38P36164 PBI2YNL015W 228 nt0.66□□□□□ -2.3
TVP38P36164 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.66□□□□□ -2.3
TVP38P36164 YOR218CYOR218C 420 nt0.66□□□□□ -2.3
TVP38P36164 SCW11YGL028C 1629 nt0.66□□□□□ -2.3
TVP38P36164 PRP16YKR086W 3216 nt0.65□□□□□ -2.31
TVP38P36164 YGR045CYGR045C 363 nt0.65□□□□□ -2.31
TVP38P36164 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.65□□□□□ -2.31
TVP38P36164 EAF6YJR082C 342 nt0.65□□□□□ -2.31
TVP38P36164 YBR012CYBR012C 420 nt0.65□□□□□ -2.31
TVP38P36164 RKR1YMR247C 4689 nt0.65□□□□□ -2.31
TVP38P36164 STO1YMR125W 2586 nt0.65□□□□□ -2.31
TVP38P36164 RFX1YLR176C 2436 nt0.65□□□□□ -2.31
TVP38P36164 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.64□□□□□ -2.31
TVP38P36164 AIM29YKR074W 468 nt0.64□□□□□ -2.31
TVP38P36164 AIM44YPL158C 2277 nt0.63□□□□□ -2.31
TVP38P36164 FMP27YLR454W 7887 nt0.63□□□□□ -2.31
TVP38P36164 YDL158CYDL158C 309 nt0.63□□□□□ -2.31
TVP38P36164 FYV7YLR068W 456 nt0.63□□□□□ -2.31
TVP38P36164 YML108WYML108W 318 nt0.63□□□□□ -2.31
TVP38P36164 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.63□□□□□ -2.31
TVP38P36164 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.63□□□□□ -2.31
TVP38P36164 SWI6YLR182W 2412 nt0.63□□□□□ -2.31
TVP38P36164 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.62□□□□□ -2.31
TVP38P36164 YGR042WYGR042W 816 nt0.62□□□□□ -2.31
TVP38P36164 YGR290WYGR290W 444 nt0.62□□□□□ -2.31
TVP38P36164 UPS1YLR193C 528 nt0.62□□□□□ -2.31
TVP38P36164 YDR269CYDR269C 324 nt0.61□□□□□ -2.31
TVP38P36164 UBC7YMR022W 498 nt0.61□□□□□ -2.31
TVP38P36164 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.61□□□□□ -2.31
TVP38P36164 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.61□□□□□ -2.31
TVP38P36164 LCD1YDR499W 2244 nt0.61□□□□□ -2.31
TVP38P36164 RIM20YOR275C 1986 nt0.61□□□□□ -2.31
TVP38P36164 YDL206WYDL206W 2289 nt0.61□□□□□ -2.31
TVP38P36164 SLY1YDR189W 2001 nt0.6□□□□□ -2.31
TVP38P36164 RRT1YBL048W 312 nt0.6□□□□□ -2.31
TVP38P36164 ALY2YJL084C 3141 nt0.6□□□□□ -2.31
TVP38P36164 MYO1YHR023W 5787 nt0.59□□□□□ -2.31
TVP38P36164 ZEO1YOL109W 342 nt0.59□□□□□ -2.31
TVP38P36164 YOR199WYOR199W 330 nt0.59□□□□□ -2.31
TVP38P36164 TRS65YGR166W 1683 nt0.59□□□□□ -2.32
TVP38P36164 YDL196WYDL196W 330 nt0.58□□□□□ -2.32
TVP38P36164 SWF1YDR126W 1011 nt0.58□□□□□ -2.32
TVP38P36164 YIL059CYIL059C 366 nt0.58□□□□□ -2.32
TVP38P36164 YBL071CYBL071C 309 nt0.58□□□□□ -2.32
TVP38P36164 YPL182CYPL182C 384 nt0.58□□□□□ -2.32
TVP38P36164 PDE2YOR360C 1581 nt0.57□□□□□ -2.32
TVP38P36164 NPC2YDL046W 522 nt0.57□□□□□ -2.32
TVP38P36164 BI2Q0110 1272 nt0.57□□□□□ -2.32
TVP38P36164 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.57□□□□□ -2.32
TVP38P36164 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.57□□□□□ -2.32
TVP38P36164 AI1Q0050 2505 nt0.57□□□□□ -2.32
TVP38P36164 TIM13YGR181W 318 nt0.56□□□□□ -2.32
TVP38P36164 YNL122CYNL122C 348 nt0.56□□□□□ -2.32
TVP38P36164 TOM22YNL131W 459 nt0.56□□□□□ -2.32
TVP38P36164 ZIP2YGL249W 2115 nt0.55□□□□□ -2.32
TVP38P36164 YDL011CYDL011C 324 nt0.55□□□□□ -2.32
TVP38P36164 snR72snR72 98 nt0.55□□□□□ -2.32
TVP38P36164 YJL135WYJL135W 318 nt0.55□□□□□ -2.32
TVP38P36164 UTP10YJL109C 5310 nt0.55□□□□□ -2.32
TVP38P36164 BIR1YJR089W 2865 nt0.54□□□□□ -2.32
TVP38P36164 SLI15YBR156C 2097 nt0.54□□□□□ -2.32
TVP38P36164 YHL041WYHL041W 450 nt0.54□□□□□ -2.32
TVP38P36164 YHR125WYHR125W 306 nt0.54□□□□□ -2.32
TVP38P36164 YHR130CYHR130C 336 nt0.54□□□□□ -2.32
TVP38P36164 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.54□□□□□ -2.32
TVP38P36164 YMR321CYMR321C 318 nt0.54□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 54.7 ms