Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA11P31270 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms