Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMLP26374 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMLP26374 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMLP26374 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMLP26374 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMLP26374 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMLP26374 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMLP26374 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMLP26374 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMLP26374 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMLP26374 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMLP26374 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMLP26374 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMLP26374 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMLP26374 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMLP26374 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMLP26374 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMLP26374 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMLP26374 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMLP26374 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMLP26374 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMLP26374 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMLP26374 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMLP26374 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMLP26374 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMLP26374 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMLP26374 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMLP26374 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMLP26374 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMLP26374 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMLP26374 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMLP26374 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMLP26374 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMLP26374 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMLP26374 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMLP26374 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMLP26374 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMLP26374 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMLP26374 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMLP26374 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMLP26374 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMLP26374 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMLP26374 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMLP26374 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMLP26374 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMLP26374 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMLP26374 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMLP26374 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMLP26374 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMLP26374 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMLP26374 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMLP26374 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMLP26374 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMLP26374 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMLP26374 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMLP26374 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMLP26374 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMLP26374 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMLP26374 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMLP26374 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMLP26374 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMLP26374 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMLP26374 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMLP26374 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMLP26374 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMLP26374 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMLP26374 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMLP26374 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMLP26374 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMLP26374 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMLP26374 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMLP26374 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMLP26374 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMLP26374 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMLP26374 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMLP26374 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMLP26374 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMLP26374 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMLP26374 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMLP26374 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMLP26374 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMLP26374 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMLP26374 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMLP26374 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMLP26374 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMLP26374 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMLP26374 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMLP26374 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMLP26374 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMLP26374 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMLP26374 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMLP26374 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMLP26374 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMLP26374 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMLP26374 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMLP26374 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMLP26374 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMLP26374 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMLP26374 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMLP26374 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms