Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms