Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRCP08575 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms