Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms