Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASKO14936 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASKO14936 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASKO14936 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASKO14936 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASKO14936 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASKO14936 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASKO14936 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASKO14936 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASKO14936 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASKO14936 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASKO14936 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASKO14936 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASKO14936 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASKO14936 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASKO14936 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASKO14936 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CASKO14936 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASKO14936 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CASKO14936 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CASKO14936 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASKO14936 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASKO14936 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASKO14936 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASKO14936 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASKO14936 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASKO14936 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASKO14936 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASKO14936 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASKO14936 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CASKO14936 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASKO14936 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASKO14936 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASKO14936 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASKO14936 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASKO14936 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASKO14936 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASKO14936 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASKO14936 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASKO14936 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASKO14936 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASKO14936 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASKO14936 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASKO14936 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASKO14936 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASKO14936 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CASKO14936 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASKO14936 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CASKO14936 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASKO14936 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASKO14936 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASKO14936 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASKO14936 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASKO14936 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASKO14936 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASKO14936 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASKO14936 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASKO14936 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASKO14936 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASKO14936 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASKO14936 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASKO14936 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASKO14936 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASKO14936 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASKO14936 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASKO14936 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASKO14936 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASKO14936 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASKO14936 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASKO14936 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASKO14936 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASKO14936 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASKO14936 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASKO14936 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASKO14936 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASKO14936 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASKO14936 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASKO14936 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASKO14936 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASKO14936 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASKO14936 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASKO14936 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASKO14936 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASKO14936 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASKO14936 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASKO14936 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASKO14936 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASKO14936 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASKO14936 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASKO14936 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASKO14936 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASKO14936 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASKO14936 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASKO14936 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASKO14936 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASKO14936 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASKO14936 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASKO14936 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASKO14936 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASKO14936 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms