Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIP1O00291 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIP1O00291 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIP1O00291 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIP1O00291 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIP1O00291 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIP1O00291 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIP1O00291 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HIP1O00291 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIP1O00291 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIP1O00291 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIP1O00291 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIP1O00291 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIP1O00291 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIP1O00291 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIP1O00291 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIP1O00291 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIP1O00291 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIP1O00291 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIP1O00291 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIP1O00291 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIP1O00291 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIP1O00291 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HIP1O00291 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIP1O00291 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIP1O00291 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIP1O00291 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HIP1O00291 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIP1O00291 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIP1O00291 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIP1O00291 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIP1O00291 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIP1O00291 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIP1O00291 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HIP1O00291 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIP1O00291 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIP1O00291 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIP1O00291 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIP1O00291 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIP1O00291 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIP1O00291 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIP1O00291 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIP1O00291 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIP1O00291 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIP1O00291 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIP1O00291 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIP1O00291 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIP1O00291 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HIP1O00291 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HIP1O00291 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIP1O00291 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HIP1O00291 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIP1O00291 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIP1O00291 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HIP1O00291 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIP1O00291 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIP1O00291 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIP1O00291 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIP1O00291 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIP1O00291 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIP1O00291 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIP1O00291 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIP1O00291 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIP1O00291 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIP1O00291 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIP1O00291 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIP1O00291 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIP1O00291 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIP1O00291 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIP1O00291 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIP1O00291 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIP1O00291 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIP1O00291 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIP1O00291 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIP1O00291 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIP1O00291 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIP1O00291 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIP1O00291 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIP1O00291 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIP1O00291 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIP1O00291 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIP1O00291 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIP1O00291 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIP1O00291 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HIP1O00291 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIP1O00291 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIP1O00291 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIP1O00291 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIP1O00291 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIP1O00291 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIP1O00291 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIP1O00291 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIP1O00291 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIP1O00291 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIP1O00291 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIP1O00291 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIP1O00291 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIP1O00291 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIP1O00291 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIP1O00291 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms