Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRDCB7Z8K6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms