Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL451085.1-201ENST00000604546 690 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Metazoa_SRP.82-201ENST00000611637 265 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR1273H-201ENST00000612921 116 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNVU1-19-201ENST00000613023 167 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC135068.6-201ENST00000625294 622 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADD3-AS1-203ENST00000625954 472 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012594.1-254ENST00000628002 438 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC26A5-206ENST00000393727 2270 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO47-201ENST00000378079 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC132219.2-201ENST00000624416 2327 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR1I3-202ENST00000367980 1403 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBNL3-203ENST00000370849 1444 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CALCOCO2-203ENST00000416445 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073324.1-201ENST00000425993 1435 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 F11-AS1-202ENST00000508110 1512 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDY7P-201ENST00000429883 1604 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX24-201ENST00000330836 2738 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGC27382-202ENST00000436742 1993 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCAF13-210ENST00000618975 2038 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEL1L3-201ENST00000264868 4369 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEF2C-232ENST00000629612 2851 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMP26-201ENST00000300762 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR2T10-201ENST00000330500 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR548XHG-201ENST00000355189 673 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A14-203ENST00000361980 969 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP426-201ENST00000362901 121 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP452-201ENST00000363004 119 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRBV6-6-201ENST00000390371 388 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM199-202ENST00000395404 971 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRO-202ENST00000398439 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANXA2P3-201ENST00000404883 1008 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073873.1-201ENST00000433950 276 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCBP1-AS1-242ENST00000458686 1020 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092953.1-201ENST00000460975 543 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR2A1-AS1-203ENST00000468575 568 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MNX1-204ENST00000469500 209 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL401P-201ENST00000470065 298 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL122013.1-201ENST00000473054 801 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004917.1-202ENST00000475791 760 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DKK2-202ENST00000510463 908 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGKV2-14-201ENST00000517571 347 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090193.2-201ENST00000518970 537 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXA-AS2-206ENST00000521159 800 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1C-AS3-201ENST00000543559 444 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAS2R38-201ENST00000547270 1143 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC015871.1-201ENST00000557880 1081 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC133485.3-201ENST00000562604 262 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138907.3-201ENST00000563937 262 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012186.1-201ENST00000566702 398 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138869.2-201ENST00000569850 262 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL473P-201ENST00000580341 299 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL493P-201ENST00000580401 299 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016629.2-201ENST00000597341 199 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL35-204ENST00000605125 833 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087623.4-201ENST00000606593 695 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNF4A-AS1-202ENST00000609152 413 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL121890.4-201ENST00000616569 609 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR8078-201ENST00000619811 84 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR5AR1-201ENST00000624596 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355480.3-201ENST00000630128 96 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC097493.5-201ENST00000641103 1010 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001347.1-201ENST00000428809 1332 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEF1A1P11-201ENST00000415278 1389 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEF1A1P3-201ENST00000417549 1385 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABRR3-203ENST00000621172 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEACAM5-208ENST00000615021 1694 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTA3-204ENST00000406911 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL9P1-201ENST00000506012 2561 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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