Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 NUMB-214ENST00000555238 3588 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 OSBPL6-202ENST00000315022 2999 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 CLRN1-202ENST00000327047 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 GJA1-201ENST00000282561 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 ZNF101-208ENST00000592502 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 CCDC30-202ENST00000342022 3098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 SNORA7B-201ENST00000384360 139 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 SLC25A5P2-201ENST00000413713 897 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 AL645634.1-201ENST00000418426 462 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 AC111200.2-201ENST00000418877 505 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 AC114760.1-201ENST00000420310 652 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 SATB1-AS1-202ENST00000425799 611 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 RPL12P19-201ENST00000429825 486 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 KRTAP9-11P-201ENST00000431013 525 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 AC108448.2-201ENST00000431546 730 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 C5orf67-201ENST00000438651 765 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 ADAMTS9-AS2-204ENST00000485174 573 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 AC097103.2-205ENST00000515247 567 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 AP005597.3-201ENST00000532369 799 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 AC007751.2-201ENST00000534173 291 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 PRR13-207ENST00000549581 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 AC233290.2-201ENST00000552852 390 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 AP001025.3-201ENST00000578787 864 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 MIR4314-201ENST00000583321 92 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 C10orf82-203ENST00000588184 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 RPL27-205ENST00000589037 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 AL021808.1-201ENST00000604325 1117 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 AC009686.2-201ENST00000607017 577 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 TTC23L-208ENST00000610313 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 LINC01125-248ENST00000627284 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 CXCR2-201ENST00000318507 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 AC139491.2-201ENST00000515403 3632 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 MTRF1-202ENST00000379477 1948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 PKP4-AS1-201ENST00000342892 4067 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 STOM-201ENST00000286713 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 PNN-201ENST00000216832 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 ZNF182-202ENST00000396965 3586 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 LNPK-201ENST00000272748 7610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 MFAP3L-202ENST00000393702 1505 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 AC104078.1-201ENST00000499292 1448 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 AC135178.2-201ENST00000582471 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 MEF2C-221ENST00000514015 2772 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 C7orf31-202ENST00000409280 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 ZNF567-204ENST00000588311 2042 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 MRPL22-206ENST00000522038 3162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 AC103760.1-201ENST00000521326 1486 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 THAP12P7-201ENST00000520248 2290 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 ZADH2-202ENST00000537114 3205 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 FO393411.1-201ENST00000325612 420 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 AL161787.1-201ENST00000401543 174 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 IL6-202ENST00000401630 765 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 SLC2A11-205ENST00000403208 564 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 AL080285.1-201ENST00000404225 984 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 RNA5SP265-201ENST00000411023 111 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 AC099560.1-201ENST00000412811 500 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 AC005999.1-201ENST00000414409 588 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 NONOP2-201ENST00000414613 1231 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 AC128709.3-201ENST00000420213 626 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 GH2-202ENST00000423893 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 ANKRD54P1-201ENST00000433115 471 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 SALL1P1-201ENST00000438101 3837 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 AC091808.1-201ENST00000438867 786 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 AC104695.1-201ENST00000439700 849 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 AL451081.2-201ENST00000448115 933 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 OR7H1P-201ENST00000448965 922 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 GH2-204ENST00000456543 794 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 AC018695.1-201ENST00000484096 664 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 EFCAB10-204ENST00000485614 799 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 SNRPD2P1-201ENST00000489253 354 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 RN7SL416P-201ENST00000494042 298 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 AC091839.1-201ENST00000513087 269 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 CAPSL-204ENST00000514524 656 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 C5orf58-202ENST00000517575 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 C14orf159-210ENST00000518665 959 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 CARD8-214ENST00000520007 614 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 HDAC2-AS2-211ENST00000520034 790 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 TMEM269-202ENST00000536543 983 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 PRR13-205ENST00000549068 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 AC013457.1-201ENST00000556770 1011 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 AC023905.1-203ENST00000560180 765 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 AC021382.2-201ENST00000584547 922 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 RN7SL840P-201ENST00000606883 284 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 AL022324.3-201ENST00000609330 747 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 AL390037.1-201ENST00000610918 431 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 RNVU1-19-201ENST00000613023 167 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 AL390882.1-201ENST00000618821 594 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 DTNA-209ENST00000556414 1626 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 NPIPB9-202ENST00000550983 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGFRP43088 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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