Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms