Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms