Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms