Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms