Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms