Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP19Q99542 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms