Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC115Q96NT0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms