Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM52Q96A61 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM52Q96A61 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM52Q96A61 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM52Q96A61 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM52Q96A61 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM52Q96A61 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM52Q96A61 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM52Q96A61 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM52Q96A61 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM52Q96A61 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM52Q96A61 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM52Q96A61 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM52Q96A61 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM52Q96A61 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM52Q96A61 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM52Q96A61 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM52Q96A61 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM52Q96A61 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM52Q96A61 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM52Q96A61 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM52Q96A61 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM52Q96A61 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM52Q96A61 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM52Q96A61 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM52Q96A61 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM52Q96A61 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM52Q96A61 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM52Q96A61 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM52Q96A61 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM52Q96A61 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM52Q96A61 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM52Q96A61 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM52Q96A61 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM52Q96A61 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms